Un studiu recente publicatu inMicrobiomaanu realizatu analisi metagenomiche virali nantu à 846 picculi mammiferi salvatichi - cumpresi pipistrelli, roditori è toporagni - raccolti in Sierra Leone, Africa Occidentale. U studiu hà identificatu un totale di 39 virus à RNA assuciati à i mammiferi, cumpresi 26 virus novi è 13 virus cunnisciuti prima. Trà questi, a famiglia Paramyxoviridae hà mostratu a più alta diversità, mentre chì i roditori allughjavanu u più grande numeru di spezie virali (n = 26).
A valutazione di u risicu zoonoticu hà rivelatu trè virus zoonotici cunnisciuti - u virus di l'encefalomiocardite, u virus Lassa è u Rocahepevirus sp. - è ancu trè virus cù un risicu potenziale di spillover: u virus Melian, u virus di l'epatite di i roditori è l'Hunnivirus A. In particulare, trà i virus recentemente identificati, u Bat ledantevirus 2 hà mostratu a relazione filogenetica più vicina cù u virus Le Dantec, chì infetta l'omu. L'analisi sierologica hà ancu rilevatu anticorpi neutralizzanti contr'à questu virus in u 2,8% di i residenti lucali, ciò chì suggerisce una precedente esposizione umana, probabilmente micca rilevata.
Sti risultati mettenu in risaltu a prisenza di un reservoir virale sustanziale duminatu da i roditori in Africa Occidentale è sottolineanu l'impurtanza critica di e strategie di surviglianza integrata à l'interfaccia umanu-animale. A cumbinazione di u screening metagenomicu cù a validazione sierologica furnisce un quadru robustu per identificà i virus cù un putenziale zoonoticu è di spillover.
In l'ultima dicina d'anni, più di u 60% di e malatie infettive emergenti in l'omu sò uriginate da riservori animali, cù i pipistrelli, i roditori è i toporagni ricunnisciuti cum'è ospiti chjave di virus zoonotici. L'Africa hè largamente cunsiderata cum'è un puntu caldu per e malatie zoonotiche. Per esempiu, a Sierra Leone hà signalatu più di 28 000 casi durante l'epidemia d'Ebola 2014-2016.
Malgradu u pesu significativu di e malatie zoonotiche in questa regione, a diversità è a distribuzione di i virus in i picculi mammiferi salvatichi fermanu insufficientemente caratterizate. Per risolve sta lacuna, i circadori anu realizatu un'analisi sistematica di u viroma di 846 picculi mammiferi salvatichi catturati in trè siti in Sierra Leone trà u 2018 è u 2023. U studiu hà avutu cum'è scopu di caratterizà a diversità virale, identificà i candidati cù un putenziale di trasmissione interspecie, valutà u risicu zoonoticu è generà evidenze per sustene i sistemi di alerta precoce per e malatie infettive emergenti.
Metodi principali
U studiu hà applicatu un flussu di travagliu cumpletu di metagenomica virale:
- Trasfurmazione di campioni:I tessuti di u core, di u fegatu, di a milza, di i pulmoni è di i reni sò stati raccolti, raggruppati, omogeneizzati è sottumessi à l'estrazione tutale di l'ARN.
- Sequenziamentu è assemblaggio:L'esaurimentu di l'ARN ribosomiale hè statu realizatu prima di a custruzzione di a biblioteca, seguitu da un sequenziamentu à altu rendimentu utilizendu a piattaforma Illumina NovaSeq 6000. I contig virali sò stati assemblati de novo.
- Identificazione di u virus:I virus sò stati identificati basendu si nantu à l'allineamentu di u genu di l'ARN polimerasi RNA-dipendente (RdRp). Solu i virus assuciati à i vertebrati sò stati cunservati, escludendu i virus batterichi, fungini è vegetali.
- Analisi bioinformatica:Sò state realizate a ricustruzione filogenetica, l'analisi di ricombinazione, a modellazione di a rete di trasmissione interspecie è a valutazione di u risicu zoonoticu.
- Validazione sierologica:Un test di neutralizazione di pseudovirus basatu annantu à VSV hè statu sviluppatu per Bat ledantevirus 2. Anticorpi neutralizzanti sò stati rilevati in u 2,8% di i sieri umani, furnendu evidenza di una putenziale trasmissione zoonotica.
StudiuRisultati
1. Scuperta virale è diversità
Questu studiu hà realizatu un'analisi di sequenziamentu trascrittomicu annantu à 846 animali salvatichi raccolti in Sierra Leone, cumpresi roditori, pipistrelli è toporagni. Basatu annantu à e sequenze cumplete di u gene di l'ARN polimerasi RNA-dipendente (RdRp), sò stati identificati un totale di 39 virus RNA assuciati à i mammiferi, cumpresi 13 virus prima cunnisciuti è 26 novi virus.
In termini di cumpusizione virale, a famiglia Paramyxoviridae hà mostratu u più altu livellu di diversità in tutti i trè ordini d'ospiti, seguitata da Astroviridae è Picornaviridae. In quantu à a distribuzione di l'ospiti, i roditori anu cuntribuitu a più grande diversità virale, allughjendu un totale di 26 spezie di virus, ciò chì indica u so rolu prominente cum'è riservori di diversità virale in a regione.
2. Risicu zoonoticu
A valutazione di u risicu zoonoticu hà identificatu trè virus zoonotici cunnisciuti: u virus di l'encefalomiocardite, u virus Lassa è e spezie di Rocahepevirus. Inoltre, trè virus - u virus Melian, u virus di l'epatite di i roditori è l'Hunnivirus A - sò stati identificati cum'è avendu un risicu potenziale di spillover.
Trà i 26 virus scuperti di recente, quattru eranu previsti per pussede un altu putenziale zoonoticu basatu annantu à e caratteristiche filogenetiche è genomiche. In particulare, u Bat ledantevirus 2 hà mostratu a relazione filogenetica più vicina cù u virus Le Dantec chì infetta l'omu cunnisciutu.
L'indagine sierologica successiva hà ancu sustinutu sta scuperta, postu chì l'anticorpi neutralizzanti contr'à u Bat ledantevirus 2 sò stati rilevati in u 2,8% di i sieri di i residenti lucali. Stu risultatu suggerisce chì infezioni micca ricunnisciute o asintomatiche puderanu esse digià accadute in a pupulazione umana, mettendu in risaltu una via di trasmissione zoonotica putenziale ma prima micca rilevata.
3. Dinamica di trasmissione trà spezie
L'analisi di trasmissione interspecie hà dimustratu chì i roditori occupanu una pusizione cintrali in a rete di spartera virale, agendu cum'è nodi chjave chì facilitanu u scambiu virale trà e spezie ospiti. Un totale di 15 virus sò stati identificati cum'è avendu u putenziale per a trasmissione interspecie.
Un'ulteriore analisi di i mudelli di trasmissione incrociata hà indicatu chì a spartera virale si verificava più frequentemente trà l'ospiti in u listessu ordine tassonomicu, ciò chì suggerisce chì a relazione trà l'ospiti ghjoca un rolu impurtante in a dinamica di trasmissione. In cuntrastu, i pipistrelli anu mostratu una capacità relativamente più bassa di trasmissione incrociata.
Impurtantemente, l'evidenza di l'espansione di a gamma di l'ospiti hè stata osservata in certi virus. Per esempiu, u virus Melian, chì prima era cunsideratu specificu per i toporagni, hè statu ancu rilevatu in i roditori in questu studiu, indicendu un putenziale cambiamentu in l'adattabilità di l'ospite è un risicu aumentatu di trasmissione più larga.
Cunclusioni è Implicazioni per a Salute Publica
- Alta diversità di viromi in i picculi mammiferi salvatichi:A scuperta di 39 virus à RNA, cumprese 26 nuove spezie, rivela un grande reservoir di virus in a regione è segnala per a prima volta novi virus cù un altu putenziale zoonoticu (per esempiu, Bat ledantevirus 2).
- I roditori cum'è obiettivi di surveglianza prioritari:I roditori agiscenu cum'è centri chjave per a trasmissione virale è portanu a più alta diversità virale, rapprisentendu u più grande risicu di spillover.
- Bisognu di strategie di surviglianza integrate:I risultati sustenenu a priorità di i roditori in i prugrammi di surviglianza attiva è l'implementazione d'approcci integrati chì combinanu metagenomica, sierologia è monitoraghju ecologicu à l'interfacce uomo-fauna selvatica.
In generale, questu studiu furnisce evidenze critiche per sustene i sistemi d'alerta precoce è i quadri di valutazione di i risichi per e malatie zoonotiche emergenti, rinfurzendu l'impurtanza di a surveglianza proattiva in e regioni à altu risicu.
Infurmazioni nantu à u produttu
Data di publicazione: 23 di marzu di u 2026