Un studiu metagenomicu recente hà rivelatu un spettru rimarchevulimente diversu di virus è batteri purtati da i roditori in a pruvincia di Heilongjiang, cumpresi u virus Lassa, u virus Amur, Salmonella è Yersinia pestis.
A ricerca hà utilizatu uKit d'arricchimentu di RNA di patogeni da Macro & Micro-Test, basatu annantu à a tecnulugia di cattura di sonde. Depletendu selettivamente l'rRNA di l'ospite è altri frammenti di l'ospite cunservati, u metudu hà ritenutu efficacemente l'ARN microbianu, migliurendu significativamente a sensibilità di rilevazione di i patogeni. Questa tappa d'arricchimentu di l'ARN di i patogeni hè stata cruciale per ottene un altu tassu di rilevazione è hà furnitu un forte supportu tecnicu per a surveglianza di i patogeni.
Roditori: Riservori Chjave di Malatie Zoonotiche
I roditori sò u gruppu di mammiferi u più riccu di spezie è u più largamente distribuitu, cumprendendu più di 2.000 spezie in u mondu sanu è rapprisentendu più di u 40% di tutte e spezie di mammiferi.
Oltre à a so impurtanza ecologica, i roditori servenu cum'è riservori è vettori principali di numerosi patogeni zoonotici.Siccomu l'habitat di i roditori si sovrapponenu spessu à l'ambienti umani - per via di morsi diretti, cuntattu cù escrementi, o trasmissione indiretta per via di pulci è acari - l'agenti patogeni ch'elli ospitanu rapprisentanu minacce persistenti per a salute publica.
In particulare, più di u 70% di e malatie infettive emergenti sò originarie di a fauna salvatica, cù i roditori chì rapprisentanu unu di i reservoir virali più significativi.
Regione di Frontiera di Heilongjiang: Una Prima Linea per a Sorveglianza di i Patogeni
Heilongjiang, una pruvincia di cunfine in u nordeste di a Cina, pussede risorse ecologiche abbundanti è sparte fruntiere cù parechji paesi. A cumbinazione di una ricca biodiversità è di frequenti movimenti transfrontalieri di pupulazione crea cundizioni favurevuli per a trasmissione di patogeni.
Trà ghjugnu è lugliu 2021, i circadori anu raccoltu 67 roditori salvatichi da a cità di Hengdaohezi, cità di Mudanjiang. I campioni includenu:
l 20Apodemus peninsulae
l 47Myodes rufocanus
Tutti i campioni sò stati catturati in zone residenziali è in terreni agriculi circundanti, mettendu in risaltu a stretta interfaccia trà l'insediamenti umani è l'abitati di a fauna salvatica.
Tecnulugia d'Arricchimentu di Patogeni: Superà l'Interferenza di u Sfondate di l'Ospite
In u sequenziamentu metagenomicu, l'ARN ospite domina tipicamente e letture di sequenziamentu, mascherendu i signali di patogeni di bassa abbundanza.
Per affruntà sta sfida, u studiu hà utilizatuKit di rilevazione metagenomica di patogeni Macro & Micro-Test. Utilizendu a tecnulugia di cattura di sonde, e sonde specificamente cuncepite si leganu à l'rRNA ospitante è à e sequenze cunservate, permettendu a so deplezione è arricchendu cusì l'RNA microbianu.
Questu approcciu hà migliuratu sustanzialmente a sensibilità di rilevazione di i patogeni, permettendu à u sequenziamentu à valle di recuperà una proporzione più alta di letture di patogeni. A tappa d'arricchimentu hà messu una basa solida per caratterizà accuratamente u spettru di patogeni purtatu da i roditori.
Dopu l'arricchimentu, i campioni di RNA sò stati sottumessi à trascrizione inversa, custruzzione di librerie è sequenziamentu à altu rendimentu. L'analisi bioinformatica hà inclusu:
l Filtrazione di u genomu di l'ospite
Classificazione tassonomica cù Kraken2
Currezzione di l'abbundanza cù Bracken
Stu flussu di travagliu hà generatu un prufilu cumpletu di e cumunità virali è batteriche.
Risultati di a ricerca: Co-circulazione di parechji virus è batteri
Scuperte virali
I virus rilevati appartenevanu à 21 famiglie virali, cumpreseArenaviridaeèHantaviridae.
À traversudi novuassemblaggio cù Megahit, sò stati generati 154 contig virali, di i quali 110 allineati cù 19 virus di ottu famiglie.
In Apodemus peninsulae, sò stati identificati i seguenti virus:
l Arenavirus: virus Lassa, virus Wenzhou, virus Gairo
l Hantavirus: virus Amur, virus Puumala
In Myodes rufocanus, L'arterivirus di u rattu è u virus di l'Amur sò stati rilevati.
Trà sti patogeni:
U virus Lassa hè un agente causativu di a frebba emorragica virale, cù tassi di mortalità chì righjunghjenu circa u 20%.
U virus di l'Amur hè unu di i patogeni rispunsevuli di a frebba emorragica cù sindrome renale (HFRS). A Cina segnala u più altu pesu mundiale di infezioni da hantavirus.
Scuperte batteriche
Un totale di 1.051 generi batterici sò stati annotati.
I generi i più abbundanti eranu:
lSalmonella(26–31%)
lYersinia(11–23%)
Salmonellahè un patogenu maiò di origine alimentaria, rispunsevule di circa 9 milioni di casi di frebba tifoide è circa 110 000 morti ogni annu in u mondu.
Yersinia pestis, l'agente causativu di a pesta, hè stata rispunsevule di trè pandemie storiche. A pruvincia di Heilongjiang hè ricunnisciuta cum'è unu di i fochi naturali di pesta di a Cina è ferma una regione prioritaria per a surveglianza di a pesta.
Significanza di u Studiu
Cuntribuzioni scientifiche
Questu studiu rapprisenta u primu rapportu di frammenti di virus Lassa è virus di l'arterite di u rattu in roditori di Heilongjiang, allargendu a basa di dati di patogeni trasmessi da roditori in Cina.
Caratterizza sistematicamente e cumunità virali è batteriche in e pupulazioni lucali di roditori, furnendu dati di basa per a surveglianza di e malatie zoonotiche in e regioni di fruntiera.
Implicazioni per a salute publica
I risultati mettenu in risaltu a necessità di una surveglianza cuntinua è di un screening di i patogeni.A. peninsulaeèM. rufocanus.
I dati furniscenu evidenze scientifiche chì sustenenu strategie di cuntrollu di a fonte per e malatie cum'è a pesta è a frebba emorragica cù a sindrome renale.
Punti di forza metodologichi
U sequenziamentu metagenomicu permette a rilevazione imparziale di agenti patogeni cunnisciuti è novi.
In questu studiu, a tecnulugia d'arricchimentu di patogeni di Macro & Micro-Test hà dimustratu una forte prestazione, migliurendu efficacemente a rilevazione di patogeni bersagliu in campioni biologichi cumplessi. I risultati cunfermanu a so capacità di sustene l'identificazione di patogeni ad alta sensibilità in a surveglianza di a fauna salvatica.
Raccomandazione di u produttu
Basatu annantu à a so applicazione riescita in questu studiu, u Kit d'Arricchimentu di RNA di Patogeni Macro & Micro-Test hè assai cunsigliatu per a ricerca di surveglianza metagenomica.
Riducendu efficacemente l'acidi nucleici di l'ospite è arricchendu e sequenze microbiche, u kit migliora significativamente a sensibilità di rilevazione è a qualità di i dati. Rappresenta un strumentu essenziale per una scuperta precisa di agenti patogeni in campioni cumplessi è furnisce un supportu tecnicu robustu per a surveglianza di a salute publica, a valutazione di i risichi zoonotici è a preparazione à l'epidemie.
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Data di publicazione: 02-Mar-2026