Una nova arma per a diagnosi di a tuberculosi è a rilevazione di a resistenza à i farmaci: un sequenziamentu miratu di nova generazione (tNGS) cumminatu cù l'apprendimentu automaticu per a diagnosi di l'ipersensibilità à a tuberculosi
Rapportu di literatura: CCa: un mudellu diagnosticu basatu annantu à tNGS è l'apprendimentu automaticu, chì hè adattatu per e persone cun menu tuberculosi batterica è meningite tuberculare.
Titulu di a tesi: Sequenziamentu di nova generazione miratu à a tuberculosi è apprendimentu automaticu: una strategia diagnostica ultrasensibile per i tubulari pulmonari paucifici è a meningite tubulare.
Périodique : 《Clinica Chimica Acta》
SE: 6.5
Data di publicazione: Ghjennaghju 2024
In cumbinazione cù l'Università di l'Accademia Cinese di e Scienze è l'Ospedale Chest di Pechino di l'Università Medica Capitale, Macro & Micro-Test hà stabilitu un mudellu di diagnosi di a tuberculosi basatu annantu à a nova generazione di tecnulugia di sequenziamentu miratu (tNGS) è u metudu di apprendimentu automaticu, chì hà furnitu una sensibilità di rilevazione ultra-alta per a tuberculosi cù pochi batteri è a meningite tuberculare, hà furnitu un novu metudu di diagnosi di ipersensibilità per a diagnosi clinica di dui tipi di tuberculosi, è hà aiutatu a diagnosi precisa, a rilevazione di a resistenza à i medicinali è u trattamentu di a tuberculosi. À u listessu tempu, si hè trovu chì u cfDNA plasmaticu di u paziente pò esse adupratu cum'è un tipu di campione adattatu per u campionamentu clinicu in a diagnosi di TBM.
In questu studiu, 227 campioni di plasma è campioni di fluidu cerebrospinale sò stati aduprati per stabilisce duie coorti cliniche, in quale i campioni di coorte diagnostiche di laburatoriu sò stati aduprati per stabilisce u mudellu di apprendimentu automaticu di a diagnosi di a tuberculosi, è i campioni di coorte diagnostiche cliniche sò stati aduprati per verificà u mudellu diagnosticu stabilitu. Tutti i campioni sò stati prima mirati da un gruppu di sonde di cattura mirate appositamente cuncipite per Mycobacterium tuberculosis. Dopu, basatu annantu à i dati di sequenziamentu TB-tNGS, u mudellu di l'arburu di decisione hè adupratu per realizà una validazione incruciata à 5 volte nantu à i gruppi di furmazione è di validazione di a coda diagnostica di laburatoriu, è si ottenenu e soglie diagnostiche di i campioni di plasma è di i campioni di fluidu cerebrospinale. A soglia ottenuta hè purtata in dui gruppi di test di a coda di diagnosi clinica per a rilevazione, è a prestazione diagnostica di l'apprendista hè valutata da a curva ROC. Infine, hè statu ottenutu u mudellu di diagnosi di a tuberculosi.
Fig. 1 schema di u disignu di a ricerca
Risultati: Sicondu i limiti specifichi di u campione di DNA di CSF (AUC = 0,974) è di u campione di cfDNA di plasma (AUC = 0,908) determinati in questu studiu, trà 227 campioni, a sensibilità di u campione di CSF era di 97,01%, a specificità era di 95,65%, è a sensibilità è a specificità di u campione di plasma eranu di 82,61% è 86,36%. In l'analisi di 44 campioni accoppiati di cfDNA di plasma è DNA di fluidu cerebrospinale da pazienti cun TBM, a strategia diagnostica di questu studiu hà una alta consistenza di 90,91% (40/44) in cfDNA di plasma è DNA di fluidu cerebrospinale, è a sensibilità hè di 95,45% (42/44). In i zitelli cun tuberculosi pulmonare, a strategia diagnostica di questu studiu hè più sensibile à i campioni di plasma chè i risultati di rilevazione Xpert di campioni di suchju gastricu da i stessi pazienti (28,57% VS 15,38%).
Fig. 2 Prestazione di l'analisi di u mudellu di diagnosi di tuberculosi per campioni di pupulazione
