Una nova arma per a diagnosi di a tuberculosi è a rilevazione di resistenza à a droga: una nova generazione di sequenza mirata (tNGS) cumminata cù l'apprendimentu automaticu per a diagnosi di ipersensibilità di a tuberculosi.
Rapportu di letteratura: CCa: un mudellu di diagnosticu basatu annantu à tNGS è machine learning, chì hè adattatu per e persone cun tuberculosis menu bacterial è meningitis tuberculosa.
Tìtulu di a tesi: Sequenza di a prossima generazione è apprendimentu automaticu per i tuberculosi: una strategia diagnostica ultra-sensibile per i tubulari pulmonari paucifici è a meningite tubulare.
Périodique : 《Clinica Chimica Acta》
IF: 6.5
Data di publicazione: ghjennaghju 2024
Cumminatu cù l'Università di l'Academia Cinese di Scienze è l'Hospital Chest di Pechino di l'Università Medica di Capitale, Macro & Micro-Test hà stabilitu un mudellu di diagnosi di a tuberculosi basatu nantu à a nova generazione di tecnulugia di sequenza mirata (tNGS) è u metudu d'apprendimentu automaticu, chì furnisce ultra-altu. sensibilità di deteczione per a tuberculosis cù pocu battìri è meningitis tuberculosis, furnia un novu metudu di diagnosi di ipersensibilità per u diagnosticu clinicu di dui tipi di tuberculosis, è aiutau à u diagnosticu precisu, a deteczione di resistenza à a droga è u trattamentu di a tuberculosis.À u listessu tempu, si trova chì u cfDNA di plasma di u paziente pò esse usatu cum'è un tipu di mostra adattatu per u campionamentu clinicu in u diagnosticu di TBM.
In questu studiu, 227 campioni di plasma è campioni di fluidu cerebrospinal sò stati usati per stabilisce duie cohorti cliniche, in quale i campioni di cohorte di diagnostichi di laboratoriu sò stati utilizati per stabilisce u mudellu d'apprendimentu automaticu di diagnosi di tuberculosi, è i campioni di cohorte di diagnostichi clinichi sò stati usati per verificà u stabilimentu stabilitu. mudellu di diagnosticu.Tutti i campioni sò stati prima destinati da una piscina di sonda di cattura apposta apposta per Mycobacterium tuberculosis.Dopu, basatu nantu à i dati di sequenza di TB-tNGS, u mudellu di l'arbre di decisione hè utilizatu per realizà una validazione incrociata di 5 volte nantu à i setti di furmazione è validazione di a fila di diagnostica di u laboratoriu, è sò ottenuti i soglia di diagnostica di campioni di plasma è campioni di fluidu cerebrospinale.U sogliu ottenutu hè purtatu in dui gruppi di teste di fila di diagnosi clinica per a rilevazione, è a prestazione diagnostica di l'apprendente hè evaluata da a curva ROC.Infine, u mudellu di diagnosi di a tuberculosi hè stata ottenuta.
Fig. 1 diagramma schematicu di u disignu di ricerca
Risultati: Sicondu i soglia specifichi di campionu di DNA CSF (AUC = 0.974) è campione di cfDNA plasma (AUC = 0.908) determinati in stu studiu, trà 227 campioni, a sensibilità di u campione CSF era 97.01%, a specificità era 95.65%, è a sensibilità è a specificità di a mostra di plasma eranu 82,61% è 86,36%.In l'analisi di 44 campioni accoppiati di cfDNA plasma è DNA di fluidu cerebrospinal da i pazienti TBM, a strategia di diagnostica di stu studiu hà una alta consistenza di 90.91% (40/44) in plasma cfDNA è DNA di fluidu cerebrospinale, è a sensibilità hè 95.45% (42/44).In i zitelli cù tuberculosis pulmonary, a strategia di diagnostica di stu studiu hè più sensittivi à i campioni di plasma cà i risultati di rilevazione Xpert di mostri di succo gastricu da i stessi pazienti (28,57% VS 15,38%).
Fig 2 Analysis performance of tuberculosis diagnosis model for samples population
